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R语言学习笔记:从数据清洗到高级统计学和生物信息学

作者

杜俊宏

编译日期

2024年3月10日 22:36

Bookdown Github项目 Email

制作这本学习笔记的初衷是归纳整理在医学科研领域利用R语言进行基本数据分析的技巧。计划涵盖包括数据清洗、基本统计分析、高级统计分析在内的内容。并进一步对涉及生物信息学的内容进行总结,汇总Gene Expression Omnibus(GEO)、The Cancer Genome Atlas Program(TCGA)数据库挖掘的代码,并扩展到以Seurat包为基础的单细胞分析流程。此外,也会对Quarto文档——由Posit开发的面相多编程语言的下一代R Markdown——的编写和发布进行简单总结。目前该项目处于最开始的阶段,这本书也处于刚刚搭建好框架的阶段,后续会不断更新和完善,最终实现上述的目标。敬请批评指正!

Tip

由于GitHub对文件大小的限制,本书涉及的原始数据文件(data)可通过此链接获取。


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在线书籍:

  • R Graphics Cookbook, 2nd edition:https://r-graphics.org

  • R for Data Science (2e):https://r4ds.hadley.nz

  • Quarto Guide:https://quarto.org/docs/guide/

  • Happy Git and GitHub for the useR:https://happygitwithr.com

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Citation

BibTeX citation:
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For attribution, please cite this work as:
杜俊宏. 2024. “R语言学习笔记:从数据清洗到高级统计学和生物信息学.” March 10, 2024. https://djhcod.github.io/r-notes/.
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